Stephen Dill Lee (Charleston, 22 settembre 1833 – Vicksburg, 29 maggio 1908) è stato un militare statunitense. Ufficiale nell'US Army divenne tenente generale nell'esercito degli Stati Confederati durante la guerra di secessione. Era lontano parente di Robert E. Lee.

Nato a Charleston, nella Carolina del Sud, si diplomò da West Point nel 1854 e prestò servizio nell'Esercito statunitense per sette anni, in artiglieria ed in incarichi di stato maggiore.

Nel febbraio 1861 si dimise e si unì all'Esercito confederato.

Fu membro dello stato maggiore del brigadier generale. Pierre G. T. Beauregard a Fort Sumter ed ebbe buoni risultati quale artigliere alla seconda battaglia di Bull Run e ad Antietam.

Nel Mississippi divenne brigadier generale d'artiglieria e prese parte alle battaglie di Chickasaw Bayou e Champion's Hill ed all'assedio di Vicksburg. Catturato a Vicksburg, fu scambiato e poi promosso maggior generale.

Nel maggio 1864 fu nominato comandante del Dipartimento dell'Alabama, Mississippi e Louisiana orientale. Promosso tenente generale con decorrenza 23 giugno 1864, guidò le truppe nella campagna di Atlanta, nella battaglia di Ezra Church e nelle campagne di Franklin e Nashville. Fu ferito durante la ritirata da Nashville e non fu in grado di ritornare in servizio fino alle ultime campagne delle Caroline.

Si arrese nell'aprile 1865.

Negli anni dopo la guerra visse in Mississippi, dove lavorò come piantatore. Fu membro della Legislatura dello Stato e primo presidente del "Mississippi Agricultural and Mechanical College" (Collegio del Mississippi per l'Agricoltura e la Meccanica, 1878 - 1897). Fondatore ed attivo membro dei Veterani Confederati Uniti, ne fu presidente dal 1904 al 1908. Si operò anche nella promozione dei diritti delle donne, scrisse di storia e fece sforzi per la conservazione dei siti del campo di battaglia di Vicksburg.

Morì a Vicksburg, nel Mississippi, il 29 maggio 1908.

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